205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5288 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 307 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  94.14 
 
 		 307 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  56.68 
 
 		 308 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  57.28 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  55.88 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  55.3 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  56.29 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  51.99 
 
 		 305 aa  285  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  53.27 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  50.65 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  49.34 
 
 		 307 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  51.78 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  49.34 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  49.17 
 
 		 308 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  50.67 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  52.46 
 
 		 306 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  51.99 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  51.99 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  51.49 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  53.47 
 
 		 330 aa  258  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  51.49 
 
 		 316 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  51.82 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  50.17 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  51.66 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  52.48 
 
 		 307 aa  245  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  47.33 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  52.61 
 
 		 308 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  50.83 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  47.18 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  53.11 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  43.75 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  45.3 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  42.81 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  40.47 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  33.23 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  42.09 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  31.91 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  27.21 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  28.82 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  30.07 
 
 		 394 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.29 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  30.39 
 
 		 361 aa  87  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30.9 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  26.84 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.86 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  26.58 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  27.45 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  26.67 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  27.37 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  28.41 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.83 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  27.91 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  25.42 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  27.34 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  28.73 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  27.13 
 
 		 356 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  25.54 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  25.94 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  25.94 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  28.96 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  29.72 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  26.56 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  26.16 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  28.05 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.08 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  31.76 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.08 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  32.23 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.54 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  25.77 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  25.73 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.24 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.64 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.54 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  27.95 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.54 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  26.64 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.54 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.54 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  27.3 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.54 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  29.86 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  26.04 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.34 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.57 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  29.88 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  30.15 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  37.65 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  24.74 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  36.47 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  30.53 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  36.47 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>