172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1316 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  45.45 
 
 
394 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  40.45 
 
 
356 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  41.02 
 
 
350 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  38.36 
 
 
350 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  37.42 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  35.51 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  37.69 
 
 
350 aa  169  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  37.07 
 
 
345 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  34.78 
 
 
306 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  34.42 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  35.79 
 
 
307 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  36.04 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  34.8 
 
 
360 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  34.29 
 
 
346 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  32.54 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  36.74 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  34.98 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  33.09 
 
 
305 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  34.69 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  31.05 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  32.95 
 
 
306 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.96 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  31.44 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  31.67 
 
 
356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  32.58 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  33.21 
 
 
320 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  35.65 
 
 
362 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  32.23 
 
 
308 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  34.89 
 
 
420 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  31.27 
 
 
307 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  33.95 
 
 
343 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  32.97 
 
 
307 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  33.01 
 
 
443 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  33.7 
 
 
307 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  31.58 
 
 
315 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  31.18 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  32.24 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  32.49 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  31.5 
 
 
308 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  31.42 
 
 
329 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  34.64 
 
 
348 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  33.67 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  32.72 
 
 
415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  30.63 
 
 
304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  33.09 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  31.56 
 
 
307 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  30.69 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  30.03 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30.8 
 
 
307 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.55 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  34.31 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  34.67 
 
 
306 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  33.94 
 
 
316 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  30.8 
 
 
303 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  32.48 
 
 
417 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  33.22 
 
 
301 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  32.52 
 
 
312 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  33.08 
 
 
307 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  33.46 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  33.95 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  30.72 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.71 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  34.02 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  30.97 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.41 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.01 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  23.32 
 
 
283 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  22.97 
 
 
283 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.82 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  24.44 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  25.21 
 
 
262 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  24.29 
 
 
2798 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  24.35 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  22.38 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  24.35 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  27.5 
 
 
255 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.59 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  23.91 
 
 
317 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  25.44 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  36.67 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.37 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  27.82 
 
 
255 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  23.4 
 
 
255 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  23.97 
 
 
276 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  27.66 
 
 
255 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  24.51 
 
 
271 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  28.69 
 
 
266 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.69 
 
 
266 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.95 
 
 
262 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  22.59 
 
 
286 aa  52.8  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.95 
 
 
266 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.95 
 
 
266 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.95 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  24.29 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>