92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1512 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  703    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  54.57 
 
 		 362 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  43.98 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  41.57 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  41.84 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  44.48 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  43.26 
 
 		 361 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  36.68 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  37.46 
 
 		 443 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  36.04 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  36.43 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  33.68 
 
 		 426 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  34.83 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  36.56 
 
 		 346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  31.7 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  31.89 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  31.79 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  30.19 
 
 		 427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  33.11 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  36.12 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  32.05 
 
 		 417 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  32.52 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  34.8 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  35.82 
 
 		 349 aa  126  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  31.3 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  29.29 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  33.8 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  33.8 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  35.83 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  31.91 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  31.47 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  32.31 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  29.21 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.4 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  30.65 
 
 		 307 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  30.27 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  32.37 
 
 		 303 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  32.68 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  31.23 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.99 
 
 		 315 aa  93.2  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 		 312 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.53 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  31 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  29.69 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  29.67 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  30.61 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.29 
 
 		 306 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.62 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  27.89 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.55 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.18 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  31.65 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  32.22 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  31.22 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.08 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  27.49 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  29.43 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  26.42 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.24 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  27.72 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  32.7 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  29.46 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  26.28 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.57 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  27.14 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1313  hypothetical protein  27.52 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.607522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  37.27 
 
 		 260 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  26 
 
 		 308 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  27.37 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.97 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  24.44 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  23.53 
 
 		 257 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  23.77 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  23.05 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  33.67 
 
 		 247 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  30.37 
 
 		 261 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  35.09 
 
 		 249 aa  46.2  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.04 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  25.37 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  25.37 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2123  hypothetical protein  32.41 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  21.71 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1259  hypothetical protein  32.29 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  28.26 
 
 		 439 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  29.82 
 
 		 251 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  25.24 
 
 		 293 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.15 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>