114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0644 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  815    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  77.4 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  76.92 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  75.95 
 
 		 420 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  59.52 
 
 		 426 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  59.28 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  56.1 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  55.69 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  57.11 
 
 		 443 aa  431  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 		 352 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  32.42 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 		 356 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  30.16 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  31.1 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.9 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  27.35 
 
 		 361 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  32.03 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  32.34 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  34.46 
 
 		 312 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  29.33 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  29.32 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  32.97 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  35.34 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.62 
 
 		 305 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30.6 
 
 		 307 aa  97.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  32.33 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.62 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 		 307 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  31.62 
 
 		 306 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.31 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  31.15 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.55 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.68 
 
 		 307 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  30.07 
 
 		 356 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.63 
 
 		 306 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  33.18 
 
 		 307 aa  86.3  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.71 
 
 		 315 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.24 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  28.85 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  28.19 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.86 
 
 		 308 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  32.68 
 
 		 339 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  30.64 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  28.62 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  26.97 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.21 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.02 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  25.82 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  27.11 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  29.92 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  30.12 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  26.44 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  27.86 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  30.2 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  27.5 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  27.31 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  33.83 
 
 		 2798 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  26.67 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  28.25 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.55 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  26.83 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  30.55 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  26.19 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  24.83 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  28.2 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.77 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.25 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  25.81 
 
 		 342 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  27.5 
 
 		 323 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  23.51 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  33.87 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  26.24 
 
 		 253 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  25.38 
 
 		 257 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  27.89 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  24.1 
 
 		 261 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  35.11 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  35.11 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  23.17 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  35.11 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  35.11 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  35.16 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  35.16 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  37.21 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  37.21 
 
 		 266 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  37.08 
 
 		 139 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.61 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  30.33 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.59 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  41.98 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  28.83 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  30.23 
 
 		 260 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  25.1 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  37.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  32.32 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>