172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2157 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2157  permease  100 
 
 		 256 aa  487  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  61.42 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  61.42 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  51.37 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  55.34 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  53.75 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  53.75 
 
 		 264 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  53.75 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  53.75 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  53.75 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  53.75 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  53.36 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  50.39 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  53.75 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  54.15 
 
 		 262 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  53.36 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  45.02 
 
 		 261 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  54.15 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  47.04 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  49.42 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  46.64 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  47.04 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  46.64 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  51.78 
 
 		 261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  45.82 
 
 		 261 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  46.8 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  44.18 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  52.17 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  43.25 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  52.96 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  47.31 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  52.96 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  52.96 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  43.33 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  49.24 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  51.97 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  51.97 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  45.67 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  43.04 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  44.77 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  44.84 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  43.46 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  45.15 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  43.31 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  42.97 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  42.47 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  48.03 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  42.26 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  43.58 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  38.19 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  36.25 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  41.63 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  41.1 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  46.22 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  35.14 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  42.62 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  35.08 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  38.37 
 
 		 332 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  36.65 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  37.88 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  37.13 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  32.67 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  35.69 
 
 		 307 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  33.59 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  35.57 
 
 		 309 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  28.92 
 
 		 250 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  43.08 
 
 		 131 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  60.81 
 
 		 119 aa  89.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  31.89 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  29.57 
 
 		 249 aa  62  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  27.82 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  23.88 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25.99 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.19 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  26.2 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  26.94 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.54 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  24.43 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  25.53 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  25.98 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  25.55 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.31 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  27.73 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  27.73 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  23.53 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  27.6 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  24.91 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  24.91 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  25.19 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  23.67 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  23.99 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  25.43 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  22.22 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  25.96 
 
 		 308 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.12 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>