172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0968 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  518  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  40.93 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  37.01 
 
 		 257 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  36.05 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  37.6 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  39.84 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  35.52 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  36.86 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  37.88 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  36.68 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  36.09 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  35.98 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  40.6 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  37.45 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  39.92 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  39.15 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  38.17 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  36.82 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  38.76 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  38.76 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  37.65 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  37.25 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  37.45 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  37.08 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  35.16 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  38.76 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  42.97 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  38.55 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  42.91 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  36.09 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  43.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  42.53 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  42.53 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  44.02 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  34.52 
 
 		 250 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  41.63 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  43.63 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  41.83 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  41.83 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  41.83 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  41.83 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  41.83 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  35.86 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  41.44 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  38.52 
 
 		 257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  41.44 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  41.89 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  42.21 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  33.73 
 
 		 323 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  36.07 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  37.31 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  36.89 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  33.88 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  39.34 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  39.34 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  39.34 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  36.48 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  36.13 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  35.68 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  41.51 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  36.1 
 
 		 307 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  34.92 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  38.78 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  36.48 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  36.33 
 
 		 329 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  35.66 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  33.2 
 
 		 332 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.4 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  26.58 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.34 
 
 		 305 aa  72  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.71 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  26.44 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  25.84 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  31.27 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.37 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  31.37 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  42.35 
 
 		 119 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25.62 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  29.53 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  25.62 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.1 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.59 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  24.91 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  26.67 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  26.39 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  26.85 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  24.65 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  25.61 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  25.1 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.2 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  25.44 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  25.46 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  27.62 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.13 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  25.2 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>