157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2340 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  84.79 
 
 		 263 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  71.48 
 
 		 263 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  69.66 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  51.67 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  49.43 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  47.71 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  46.51 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  47.49 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  48.52 
 
 		 260 aa  207  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  46.72 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  46.95 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  47.27 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  45.28 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  51.74 
 
 		 262 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  51.35 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  51.35 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  42.97 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  46.97 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  50.97 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  49.03 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  50.78 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  50.39 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  50.39 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  50.39 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  50.39 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  50.39 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  50.39 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  48.66 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  47.88 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  49.04 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  49.81 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  48.46 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  44.02 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  50.85 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  50.42 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  50.42 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  46.33 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  39.09 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  45 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  46.39 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  40.85 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  47.53 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  41.28 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  43.8 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  32.56 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  33.07 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  33.2 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  44.78 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  37.26 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  35.5 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  35.69 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  32.95 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  38.35 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  34.08 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  33.2 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  33.45 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  34.25 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  29.84 
 
 		 250 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  28.78 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 131 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  48.39 
 
 		 119 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  33.47 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.18 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  30.8 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  25.79 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  25.79 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.38 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  28.74 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.69 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  24.7 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  23.76 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  29.72 
 
 		 307 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  25.98 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1464  hypothetical protein  26.81 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625984  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  26.33 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  25.18 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  26.69 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  26.33 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.86 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  25.6 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.32 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  25.9 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 		 320 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.75 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.34 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  23.38 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  26.07 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  28.35 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  24.68 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>