144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2426 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  484  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  90.48 
 
 		 257 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  90.91 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  73.59 
 
 		 257 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  73.16 
 
 		 257 aa  331  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  61.54 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  49.4 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  49.42 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  49.22 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  44.4 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  43.8 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  46.01 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  46.85 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  45.71 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  48.05 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  48.05 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  47.66 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  49.05 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  48.05 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  45.91 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  46.64 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  46.64 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  44.98 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  46.64 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  46.64 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  46.48 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  45.85 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  48.09 
 
 		 263 aa  184  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  45.31 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  44.79 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  46.48 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  43.32 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  45.45 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  42.92 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  45.26 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  44.9 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  48.83 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  46.72 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  43.93 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  48.05 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  46.48 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  47.41 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  47.41 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  42.69 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  39.59 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  41.08 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  35.22 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  38.31 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  34.82 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  37.15 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  35.95 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  40.69 
 
 		 262 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  36.33 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  35.97 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  40.77 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  36.78 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  63.56 
 
 		 131 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  38.58 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  35.18 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  34.26 
 
 		 323 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  36.23 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  32.53 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  61.7 
 
 		 119 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 		 309 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  33.07 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  33.49 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  29.67 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  40.51 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  40.51 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  28.24 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.15 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  47.37 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  27.31 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  26.42 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.29 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  26.07 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  27.37 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  24.53 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  26.04 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  26.07 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  36.76 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.25 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25.09 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  21.86 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.65 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  27.05 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.9 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  38.16 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  28.85 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>