114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2833 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  803    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  86.51 
 
 
415 aa  684    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  77.16 
 
 
417 aa  591  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  80 
 
 
420 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  59.62 
 
 
426 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  58.84 
 
 
428 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  58.65 
 
 
415 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  58.39 
 
 
427 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  57.21 
 
 
443 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  34.48 
 
 
352 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  33.89 
 
 
356 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  34.01 
 
 
349 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  35.35 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  32.91 
 
 
362 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  31.1 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  29.91 
 
 
361 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  29.64 
 
 
345 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  30.66 
 
 
346 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.94 
 
 
350 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.07 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  32.33 
 
 
296 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  33.21 
 
 
394 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.7 
 
 
312 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.79 
 
 
307 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.43 
 
 
307 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.48 
 
 
305 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.92 
 
 
308 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.86 
 
 
307 aa  96.3  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  34.43 
 
 
303 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  32.94 
 
 
339 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  30.51 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  31.18 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  29.34 
 
 
350 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  31.68 
 
 
330 aa  89.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  29.06 
 
 
350 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  29.89 
 
 
310 aa  87  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.55 
 
 
306 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  28.26 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  31.84 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.15 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  34.43 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  29.32 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  28.77 
 
 
307 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  28.68 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.65 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.1 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  28.29 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  27.24 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.9 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  29.34 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  28.32 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.3 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  27.96 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.21 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  27.24 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  30.25 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  28 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  29.34 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  28.74 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  27.89 
 
 
329 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  26.5 
 
 
304 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.86 
 
 
2798 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  26.74 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  28.33 
 
 
307 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.33 
 
 
309 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  26.56 
 
 
307 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  28.2 
 
 
323 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  24.73 
 
 
255 aa  56.6  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  28.32 
 
 
308 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  27.3 
 
 
300 aa  53.5  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  25.66 
 
 
257 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.17 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  26.33 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.82 
 
 
277 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  36.26 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  24.49 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  22.43 
 
 
251 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  22.43 
 
 
251 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.9 
 
 
257 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  35.48 
 
 
266 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  35.48 
 
 
266 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  43.66 
 
 
260 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  36.26 
 
 
266 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  35.48 
 
 
262 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  35.48 
 
 
262 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  33.33 
 
 
267 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  35.11 
 
 
139 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  35.56 
 
 
266 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  31.71 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  31.01 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  38.36 
 
 
264 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  27.1 
 
 
253 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  34.74 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  34.52 
 
 
269 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  39.73 
 
 
119 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  35.56 
 
 
266 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  38.16 
 
 
267 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>