More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2100 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  64.05 
 
 		 307 aa  357  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  64.69 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  60.47 
 
 		 307 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  60.47 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  62.13 
 
 		 305 aa  348  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  65.67 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  60.8 
 
 		 308 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  63.46 
 
 		 306 aa  344  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  63.12 
 
 		 306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  61.13 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  63.52 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  63.79 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  59.47 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  61.59 
 
 		 307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  59.53 
 
 		 316 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  59.8 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  59.53 
 
 		 316 aa  311  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  52.49 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  53.33 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  51.5 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  52.16 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  50.5 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  50.16 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  49.83 
 
 		 343 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  52.65 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  50.83 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  50.49 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  51.62 
 
 		 312 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  51.48 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  51.03 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  50.5 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  50.83 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  50.83 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  52.94 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  53.47 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  34.3 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  36.09 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  31.77 
 
 		 427 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  32.53 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  34.22 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  32.65 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  33.22 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  31.53 
 
 		 420 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  31.35 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  32.09 
 
 		 417 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  30.65 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  32.18 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  31.71 
 
 		 426 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  31.82 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  30.27 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  31.96 
 
 		 428 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  30.88 
 
 		 349 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  31.54 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  37.27 
 
 		 362 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  30.31 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 		 346 aa  95.9  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  32.88 
 
 		 415 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 		 345 aa  95.5  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  32.69 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  31.67 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  30.25 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  27.84 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  27.56 
 
 		 355 aa  85.9  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  26.95 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  28.2 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  27.88 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  32.34 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  29.58 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.47 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  29.66 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  29.41 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  29.41 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  29.66 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  27.14 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  26.75 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.54 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  26.75 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  26.64 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  32.25 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  33.97 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  27.8 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  27.8 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  26.71 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  27.44 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  28.75 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.95 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  25.95 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  39.76 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  31.46 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  24.25 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>