210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0245 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  587  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  89.54 
 
 		 343 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  81.05 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  79.55 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  80.92 
 
 		 308 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  77.27 
 
 		 307 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  76.97 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  58.14 
 
 		 308 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  56.81 
 
 		 307 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  55.15 
 
 		 307 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  55.33 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  56.15 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  60.86 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  52.15 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  51.32 
 
 		 307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  55.48 
 
 		 306 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  52.67 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  52.67 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  54.18 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  53.85 
 
 		 316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  51.64 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  54 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  52.49 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  52.94 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  49.34 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  52.61 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  42.72 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  50.83 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  44.52 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  41 
 
 		 305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  42.05 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  40.55 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  42.95 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  38.87 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  39.46 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  32.79 
 
 		 313 aa  148  9e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  34.51 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 		 420 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.39 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  30.18 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  33.22 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  28.28 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  26.55 
 
 		 426 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  28.42 
 
 		 361 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  25.91 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  26.22 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  26.76 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  27.5 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  26.14 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  27.05 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  24.91 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  27.05 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  28.62 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.56 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  26.22 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  25.82 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  26.16 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  26.16 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.87 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  28.06 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  25.47 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  24.56 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  26.53 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  25.09 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  23.55 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  28.37 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  29.25 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  29.5 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.71 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.49 
 
 		 2798 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  23.85 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  25.61 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.36 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  22.79 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  27.21 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  29.01 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  27.2 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  29.39 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  24.73 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  29.86 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  29.86 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.87 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  27.34 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  26.91 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  26.91 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  24.32 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  26.91 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  26.25 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  26.91 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.62 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  24.62 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.65 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  33.65 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.65 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>