12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1252 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  100 
 
 		 141 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  49.63 
 
 		 245 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  47.46 
 
 		 245 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  46.61 
 
 		 245 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  42.86 
 
 		 247 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  40.31 
 
 		 248 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  49.23 
 
 		 249 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  41.35 
 
 		 307 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  42.98 
 
 		 246 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  36.03 
 
 		 252 aa  92.8  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  33.86 
 
 		 252 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  28.71 
 
 		 317 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>