More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0542 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  47.47 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  44.83 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  50.41 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  50.21 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  51.87 
 
 		 263 aa  225  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  45.21 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  45.21 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  49.79 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  45.59 
 
 		 261 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  45.27 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  47.64 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  45.08 
 
 		 249 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  44.53 
 
 		 257 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  41.7 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  40.32 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  37.9 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  39.22 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  44.25 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  38.04 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  40.7 
 
 		 259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  38.04 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  38.04 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  38.04 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  38.04 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  40 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  39.36 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  40.56 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  37.35 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  42.04 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  39.44 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  39.44 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  39.44 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  41.63 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  41.94 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  40.96 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  40.96 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  41.37 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  39.44 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  40.96 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  40.87 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  40.96 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  40.16 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  40.87 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  40.87 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  40.87 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  40.87 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  40.87 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  40.87 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  40.87 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  40.87 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  38.34 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  39.2 
 
 		 253 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  40 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  40 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  38.91 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  44.16 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  39.76 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  36.84 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  39.27 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  38.58 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  38.58 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  39.01 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  39.91 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  38.57 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  38.62 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  39.38 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  37.39 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  41.5 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  38.58 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  33.73 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  35.02 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  34.24 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  34.63 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  34.5 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  34.13 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  34.24 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  34.5 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  34.24 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  34.55 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  38.84 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  33.61 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  34.24 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  34.24 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  34.24 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  32.53 
 
 		 251 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  34.94 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  33.74 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  35.2 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  37.25 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  35.63 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0265  hypothetical protein  36.33 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  37.8 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  34.77 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  35.68 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  34.27 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  33.59 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>