212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2432 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  461  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  72.18 
 
 
251 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  72.18 
 
 
251 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0037  hypothetical protein  72.51 
 
 
214 aa  245  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0037  hypothetical protein  72.51 
 
 
214 aa  245  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2513  hypothetical protein  73.56 
 
 
209 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.450854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  42.68 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  40.24 
 
 
254 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  41.53 
 
 
264 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  41.56 
 
 
254 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4500  hypothetical protein  40.33 
 
 
254 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000116291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0944  hypothetical protein  41.98 
 
 
254 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000183675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0744  hypothetical protein  41.15 
 
 
254 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0692  hypothetical protein  41.15 
 
 
254 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00620748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0781  hypothetical protein  41.15 
 
 
254 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  39.84 
 
 
260 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0876  hypothetical protein  41.15 
 
 
254 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67583e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0678  hypothetical protein  40.74 
 
 
254 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  30.65 
 
 
261 aa  121  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2123  hypothetical protein  31.98 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  26.29 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  28.7 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  25 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  25 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  24.62 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.09 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.03 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  25.49 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  23.9 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  24.61 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  24.77 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  26.17 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  24.72 
 
 
343 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.02 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  28.5 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  22.85 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  24.89 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  23.31 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  24.61 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  25.68 
 
 
294 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  24.81 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  26.64 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  25.96 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  24.74 
 
 
296 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  23.71 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  26.32 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  26.34 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  31.74 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  27.86 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  24.91 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  24.03 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  24.81 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  19.79 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  21.72 
 
 
307 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  25.57 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.13 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  30.3 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  25.62 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  22.47 
 
 
320 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  24.9 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  23.27 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  21.92 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.33 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  26.84 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.33 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.14 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  23.72 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.69 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  21.72 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  23.05 
 
 
307 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  26.74 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  26.79 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  24.63 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  21.46 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  21.93 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  24.88 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  27.33 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  42.86 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  27.62 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  24.74 
 
 
315 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  24.12 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  27.33 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  24.88 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  26.18 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  25 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  22.22 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  26.32 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  21.92 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  20.67 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  19.25 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  55.1 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  22.37 
 
 
261 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  21.88 
 
 
307 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26.29 
 
 
306 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  26.34 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  23.27 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  23.56 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>