143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2513 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2513  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  384  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.450854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0037  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0037  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  76.92 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  76.92 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  73.56 
 
 		 252 aa  237  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  43.78 
 
 		 257 aa  158  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  42.86 
 
 		 254 aa  157  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  41.12 
 
 		 264 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  43.2 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0678  hypothetical protein  43.43 
 
 		 254 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0944  hypothetical protein  42.93 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000183675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  44.39 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0876  hypothetical protein  42.93 
 
 		 254 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67583e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0744  hypothetical protein  42.93 
 
 		 254 aa  134  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0692  hypothetical protein  42.93 
 
 		 254 aa  134  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00620748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0781  hypothetical protein  42.93 
 
 		 254 aa  134  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4500  hypothetical protein  42.42 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000116291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  34.5 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  30.7 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  27.32 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2123  hypothetical protein  33.82 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.39 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.99 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.13 
 
 		 260 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  28.92 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  28.92 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  29.83 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.42 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.83 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  27.42 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.44 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  25.95 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  25.62 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  22.52 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.03 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  28.95 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  26.57 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  27 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.62 
 
 		 307 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  22.52 
 
 		 343 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  24.03 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  25.25 
 
 		 259 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  27.78 
 
 		 253 aa  51.6  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  27.84 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  25.95 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  31.16 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  26.57 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  24.4 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  28.65 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  24.4 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  29.93 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  29.93 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.47 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  27.87 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.47 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.47 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  24.16 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  27.87 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  28.11 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  24.3 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  38.67 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  25.27 
 
 		 265 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  28.11 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  25.79 
 
 		 246 aa  48.5  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.92 
 
 		 306 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  25.81 
 
 		 249 aa  48.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  24.64 
 
 		 265 aa  48.5  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.92 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.98 
 
 		 266 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  26.92 
 
 		 266 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  47.22 
 
 		 266 aa  48.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  23.64 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.92 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  30.96 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  27.44 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.43 
 
 		 306 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  29.44 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  27.32 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  26.28 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  24.55 
 
 		 307 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  30.3 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  30.3 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  30.3 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.04 
 
 		 294 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  22.07 
 
 		 307 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  28 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.05 
 
 		 270 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  27.13 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>