34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1742 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1742  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  487  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0319793  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1016  protein of unknown function DUF81  39.6 
 
 
263 aa  151  8e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0656  protein of unknown function DUF81  39.59 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0970  hypothetical protein  31.97 
 
 
130 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00613322  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  31.56 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0121  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  28.87 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  28.74 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  34.91 
 
 
381 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  24.16 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  24.51 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  27.32 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  25.36 
 
 
251 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  34.91 
 
 
380 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  31.25 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  24.55 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.62 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  29.28 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  22 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  25.9 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  29.28 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  29.32 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  22.22 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  26.42 
 
 
310 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  28.33 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  29.28 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  23.32 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  23.4 
 
 
309 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  25.1 
 
 
307 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  32.32 
 
 
119 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  24.14 
 
 
315 aa  42  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.36 
 
 
303 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>