67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2192 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
380 aa  744    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  82.11 
 
 
381 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  70.9 
 
 
413 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  63.94 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  63.49 
 
 
416 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  52.96 
 
 
408 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  38.71 
 
 
317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  36.74 
 
 
312 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  38.22 
 
 
318 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  31.17 
 
 
567 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  29.23 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  27.69 
 
 
323 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  28.65 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  22.87 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3290  hypothetical protein  33.04 
 
 
129 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.494268  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  26.21 
 
 
305 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  36.04 
 
 
266 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  26.21 
 
 
296 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30.84 
 
 
299 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  27.87 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  24.29 
 
 
303 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  22.79 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  29.6 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.42 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  32 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  23.88 
 
 
305 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1742  hypothetical protein  34.91 
 
 
258 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0319793  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  34.07 
 
 
266 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  31.58 
 
 
268 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  26.36 
 
 
343 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  24.73 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  21.13 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  29.91 
 
 
117 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  32.93 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.36 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.6 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  21.13 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  31.45 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  27.91 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  36.71 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  24.36 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  25.47 
 
 
276 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  36.73 
 
 
271 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  36.71 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  24.33 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  20.43 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.52 
 
 
307 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  26.61 
 
 
139 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  30 
 
 
343 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  24.3 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  30.53 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25.42 
 
 
305 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  24.68 
 
 
307 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  35.19 
 
 
268 aa  43.9  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.19 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  26.32 
 
 
316 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  30.53 
 
 
266 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  24.3 
 
 
262 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  24.3 
 
 
266 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  22.35 
 
 
270 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  28.57 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  24.3 
 
 
262 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  33.02 
 
 
301 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  28.42 
 
 
291 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  25.44 
 
 
316 aa  42.7  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  24.3 
 
 
266 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>