42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1654 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
416 aa  819    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  65.12 
 
 
381 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  63.49 
 
 
380 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  67.98 
 
 
413 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  59.67 
 
 
404 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  54.98 
 
 
408 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  38.82 
 
 
317 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
318 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  35.2 
 
 
312 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  30.92 
 
 
567 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  23.72 
 
 
322 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  23.87 
 
 
317 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  24.31 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  25.39 
 
 
305 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  23.58 
 
 
303 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.61 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  26.48 
 
 
300 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  22.88 
 
 
319 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  32.71 
 
 
299 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3290  hypothetical protein  41.18 
 
 
129 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.494268  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26.22 
 
 
306 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  26.29 
 
 
275 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  26.29 
 
 
275 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  23.9 
 
 
317 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  26.8 
 
 
275 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  24.57 
 
 
305 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  25.78 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  24.57 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  27.4 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  28.19 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  34.21 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  35.56 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  30.56 
 
 
263 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  27.12 
 
 
320 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  31.58 
 
 
255 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  33.94 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.15 
 
 
304 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  32.46 
 
 
315 aa  42.7  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  31.19 
 
 
265 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>