62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3290 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3290  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  246  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.494268  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
312 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  29.09 
 
 
318 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  33.72 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  33.72 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  33.72 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  33.72 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  29.46 
 
 
275 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  29.46 
 
 
275 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  34.21 
 
 
408 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  30.56 
 
 
317 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  33.04 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  32.74 
 
 
380 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  31.4 
 
 
266 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  35.4 
 
 
267 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  31.4 
 
 
266 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  30.97 
 
 
381 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  33.02 
 
 
307 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 
312 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  35.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 
416 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  38.16 
 
 
275 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  33.03 
 
 
567 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  37.68 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  35.23 
 
 
308 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  26.26 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  31.18 
 
 
246 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  28.42 
 
 
285 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  46.94 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  35.11 
 
 
310 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.18 
 
 
255 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  32.1 
 
 
275 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  46.94 
 
 
270 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  34.02 
 
 
362 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  44.9 
 
 
270 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  38.71 
 
 
269 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  35.71 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  30.61 
 
 
662 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  29.73 
 
 
413 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  33.01 
 
 
307 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  30.28 
 
 
354 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.03 
 
 
296 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 
305 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  32.18 
 
 
251 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  34.58 
 
 
307 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  51.28 
 
 
277 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  35.82 
 
 
277 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  33.64 
 
 
268 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.36 
 
 
304 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  25.84 
 
 
271 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  39.53 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 
258 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  31.76 
 
 
260 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  30.28 
 
 
307 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>