58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0683 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
413 aa  804    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  73.39 
 
 
381 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  70.59 
 
 
380 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  61.88 
 
 
416 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  62.67 
 
 
404 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  53.16 
 
 
408 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  37.38 
 
 
317 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  35.85 
 
 
312 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  33.96 
 
 
318 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  28.85 
 
 
567 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 
322 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  28.34 
 
 
312 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  25.58 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3290  hypothetical protein  30.28 
 
 
129 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.494268  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  34.59 
 
 
310 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  32.76 
 
 
291 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.95 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  24.72 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  28.08 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  35.87 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  29 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  24.82 
 
 
317 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  35.87 
 
 
307 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  31.53 
 
 
266 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  29.36 
 
 
263 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  28.19 
 
 
316 aa  46.6  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  35.94 
 
 
260 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  31.91 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.78 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  29.73 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  26.18 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  36.72 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  27.93 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  31.65 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  34.23 
 
 
268 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  26.9 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  34.71 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  35.87 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  35 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  35 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  29.46 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  33.02 
 
 
306 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  29.91 
 
 
117 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  36.26 
 
 
271 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  31.18 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1742  hypothetical protein  30.48 
 
 
258 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0319793  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  30.33 
 
 
330 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30.7 
 
 
307 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  32.67 
 
 
306 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  28.38 
 
 
300 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  22.39 
 
 
293 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  32.65 
 
 
268 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  26.61 
 
 
139 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  24.43 
 
 
305 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>