57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0598 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  795    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  64.27 
 
 
381 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  56.23 
 
 
408 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  63.76 
 
 
380 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  62.92 
 
 
413 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  59.33 
 
 
416 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  34.67 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  37.58 
 
 
318 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  35.67 
 
 
312 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  30.03 
 
 
567 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  27.34 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  24.24 
 
 
305 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  23.38 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  30.92 
 
 
354 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3290  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.494268  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  24.05 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  24.54 
 
 
310 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  29.75 
 
 
343 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.66 
 
 
296 aa  53.1  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.66 
 
 
305 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  28.5 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  37.5 
 
 
259 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
293 aa  49.7  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.01 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  30.98 
 
 
302 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  35.58 
 
 
259 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  28.15 
 
 
281 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  31.39 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.17 
 
 
255 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  34.62 
 
 
259 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  28.3 
 
 
312 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  30.39 
 
 
306 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  33.65 
 
 
259 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  30.1 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  36.54 
 
 
280 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  32.95 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  24.46 
 
 
276 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  33.73 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.29 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  35.58 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.89 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  29.2 
 
 
251 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  29.2 
 
 
251 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.12 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  32.18 
 
 
299 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.89 
 
 
307 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  33.88 
 
 
255 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.89 
 
 
307 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
300 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  27.27 
 
 
428 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  29.25 
 
 
260 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>