63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2726 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  750    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  85.36 
 
 
380 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  73.73 
 
 
413 aa  471  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  65.56 
 
 
404 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  65.12 
 
 
416 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  52.29 
 
 
408 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  39.55 
 
 
317 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  37.7 
 
 
312 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  38.54 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  29.64 
 
 
567 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  27.31 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  22.55 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  32.76 
 
 
291 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  26.1 
 
 
296 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3290  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.494268  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  24.33 
 
 
305 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  25.09 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  22.49 
 
 
317 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  32.71 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.58 
 
 
308 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  26.15 
 
 
300 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  28.36 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  34.51 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  25.88 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  24.43 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.36 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  21.76 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  21.76 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.97 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  35.16 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  31.45 
 
 
315 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  24.29 
 
 
303 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  34.45 
 
 
439 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1742  hypothetical protein  34.91 
 
 
258 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0319793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  24.4 
 
 
276 aa  46.2  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  46.2  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  35.19 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  25.97 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  22.43 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.99 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  23.81 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  29.91 
 
 
117 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  34.15 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  24.79 
 
 
277 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  33.03 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.33 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  31.3 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  31.82 
 
 
265 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.26 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  32.97 
 
 
308 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  36.73 
 
 
271 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.53 
 
 
304 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  34.86 
 
 
300 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  31.43 
 
 
301 aa  43.1  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  29.63 
 
 
263 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  26.77 
 
 
243 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30.58 
 
 
267 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>