86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2812 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
317 aa  640    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  68.04 
 
 
343 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  64.87 
 
 
305 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  60.69 
 
 
319 aa  344  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2891  hypothetical protein  63.92 
 
 
299 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0197559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  54.35 
 
 
317 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  51.39 
 
 
323 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  51.23 
 
 
322 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  51.23 
 
 
320 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 
318 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  26.43 
 
 
317 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  26.73 
 
 
312 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  26.96 
 
 
567 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  23.05 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  25.93 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  25.83 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  24.01 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  24.91 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  23.25 
 
 
381 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  24.91 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.55 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  24.57 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  23.16 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  21.85 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  25.68 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  24.1 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  21.32 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  22.79 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  22.42 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.45 
 
 
275 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.45 
 
 
275 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  33.63 
 
 
119 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  23.57 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5209  hypothetical protein  47.06 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  23.41 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  22.93 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  27.54 
 
 
439 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  24.65 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25.08 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  24.2 
 
 
310 aa  49.3  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  23.1 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  25.08 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  32.2 
 
 
121 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  21.67 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  25.17 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0674  hypothetical protein  45.56 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.186935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  22.67 
 
 
307 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.68 
 
 
255 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  25.17 
 
 
268 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  26.83 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  26.83 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  37.8 
 
 
283 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  30.33 
 
 
249 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  22.77 
 
 
307 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  21.69 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  37.8 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  25.66 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  24.12 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.35 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  28.3 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  34.48 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.35 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1601  Cpp22  30.77 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.52 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  25.52 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.35 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.35 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.35 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.35 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  27.42 
 
 
246 aa  43.9  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.03 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.43 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  23.15 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  23.68 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.49 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  23.04 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  27.36 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  29.46 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  31.71 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  23.63 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  27.03 
 
 
139 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  23.49 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  22.3 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  26.42 
 
 
261 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.68 
 
 
266 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>