17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5209 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5209  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  517  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  27.71 
 
 
323 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  26.11 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2891  hypothetical protein  32.81 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0197559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  28.8 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  30.74 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  36.09 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  38.14 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  30.5 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.73 
 
 
257 aa  49.3  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  29.57 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.76 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  25.95 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  27.96 
 
 
242 aa  42.7  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  22.31 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>