60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2891 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2891  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0197559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  64.56 
 
 
317 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  62.3 
 
 
305 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  61.15 
 
 
343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  53.67 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  56.47 
 
 
319 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  49.22 
 
 
320 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  47.5 
 
 
323 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  46.25 
 
 
322 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  25.54 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  25.09 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  24.21 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5209  hypothetical protein  33.19 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  25.9 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  27.33 
 
 
567 aa  59.3  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  24.71 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  22.43 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  23 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  23.57 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  21.4 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  25.26 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  24.6 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  24.2 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  28.82 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  22.75 
 
 
275 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  22.75 
 
 
275 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  23.24 
 
 
416 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  20.86 
 
 
309 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  28.38 
 
 
316 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  24.25 
 
 
257 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  26.01 
 
 
310 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  24.65 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  25.52 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.55 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.48 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  20.44 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  24.3 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  21.86 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  21.59 
 
 
408 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0674  hypothetical protein  45.56 
 
 
138 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.186935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  23.69 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  23.02 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  25.28 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  24.29 
 
 
380 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  24.78 
 
 
251 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  24.78 
 
 
251 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  23.67 
 
 
305 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  35 
 
 
299 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  23.19 
 
 
308 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  23.69 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  27.43 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  24.81 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  41.67 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  36.46 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  26.32 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  25.68 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  41.67 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  22.18 
 
 
413 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.2 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>