53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0424 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  72.27 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  62.81 
 
 		 320 aa  342  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  52.34 
 
 		 305 aa  291  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  51.39 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  45.96 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  49.38 
 
 		 343 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2891  hypothetical protein  47.95 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0197559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  43.93 
 
 		 317 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  26.69 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  26.38 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 		 567 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  26.15 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  23.72 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  28.02 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  27.31 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  25.58 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5209  hypothetical protein  35.43 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  24 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  28.15 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  25.66 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.07 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25.45 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  22.8 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  24.33 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  23.57 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0674  hypothetical protein  47.13 
 
 		 138 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.186935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  22.81 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.31 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  23.57 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  25.16 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  24.04 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  25.23 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  23.08 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  27.14 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  23.58 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  24.81 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  29.1 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.32 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  25.19 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  23.3 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  23.38 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  23.96 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 		 267 aa  42.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  24.83 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>