47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0309 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  60.69 
 
 
317 aa  328  7e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  55.97 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  57.32 
 
 
343 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2891  hypothetical protein  56.47 
 
 
299 aa  288  7e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0197559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  49.85 
 
 
317 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  53.23 
 
 
320 aa  271  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  45.96 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  44.24 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  27.33 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  25.63 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  27.12 
 
 
567 aa  89.4  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  22.14 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  26.09 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  22.06 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5209  hypothetical protein  42 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  25.99 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  28.71 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  24.58 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  24.53 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.1 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  23.36 
 
 
404 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  26.38 
 
 
307 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  25.7 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  20.22 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.53 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  22.14 
 
 
416 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  23.55 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  22.14 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  21.2 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  22.7 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  23.75 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.23 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  18.89 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  27.93 
 
 
123 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  23.29 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  26.23 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  26.23 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  20.71 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  30.36 
 
 
121 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25.25 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25.33 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  23.35 
 
 
413 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  25.6 
 
 
304 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  36.67 
 
 
271 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.4 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>