78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2440 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
567 aa  1152    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  31.07 
 
 
312 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  31.91 
 
 
317 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  29.93 
 
 
318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  27.55 
 
 
408 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  30.23 
 
 
380 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  29.9 
 
 
404 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  30.52 
 
 
416 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  28.8 
 
 
413 aa  97.8  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  27.02 
 
 
322 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  29.26 
 
 
381 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  27.13 
 
 
323 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  30.1 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  27.36 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  36.84 
 
 
251 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  36.84 
 
 
251 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  33.98 
 
 
312 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  27.33 
 
 
317 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  23.35 
 
 
304 aa  58.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  28.93 
 
 
306 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.75 
 
 
307 aa  57.4  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  26.21 
 
 
305 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  26.13 
 
 
296 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  22.52 
 
 
313 aa  54.3  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0037  hypothetical protein  37.97 
 
 
214 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0037  hypothetical protein  37.97 
 
 
214 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2513  hypothetical protein  39.73 
 
 
209 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.450854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3290  hypothetical protein  33.03 
 
 
129 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.494268  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  25.41 
 
 
305 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  27.67 
 
 
343 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  25.11 
 
 
275 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2255  hypothetical protein  29.41 
 
 
671 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00144777  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  25.11 
 
 
275 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.23 
 
 
2798 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  34.78 
 
 
291 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  34.78 
 
 
291 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  34.78 
 
 
291 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  51.6  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.56 
 
 
310 aa  51.6  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  29.73 
 
 
308 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  22.22 
 
 
303 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.98 
 
 
315 aa  51.2  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26.15 
 
 
306 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  23.81 
 
 
307 aa  49.7  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  33.04 
 
 
262 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  39.24 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  34.21 
 
 
252 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.15 
 
 
306 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  33.04 
 
 
262 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  33.04 
 
 
266 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  33.04 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  33.04 
 
 
139 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  24.86 
 
 
275 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  30.63 
 
 
307 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  32.17 
 
 
266 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  32.17 
 
 
266 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
320 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  30.36 
 
 
254 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  30.65 
 
 
266 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  30.91 
 
 
271 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  30.65 
 
 
266 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  33.7 
 
 
291 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  33.7 
 
 
291 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.43 
 
 
266 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  38.39 
 
 
259 aa  45.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.27 
 
 
330 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  27.93 
 
 
308 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  34.51 
 
 
263 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.91 
 
 
308 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  30.36 
 
 
257 aa  44.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  33.63 
 
 
263 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  26.19 
 
 
307 aa  44.3  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.44 
 
 
307 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  31.58 
 
 
266 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  38.64 
 
 
293 aa  44.3  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  27.68 
 
 
301 aa  43.9  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  25.64 
 
 
119 aa  43.5  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>