129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2244 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
317 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  73.77 
 
 
319 aa  411  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  73.97 
 
 
333 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  70.16 
 
 
315 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  73.17 
 
 
312 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  70.17 
 
 
324 aa  371  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  68.49 
 
 
307 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  67.43 
 
 
319 aa  359  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  67.52 
 
 
319 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  57.1 
 
 
301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  63.08 
 
 
320 aa  312  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  57.29 
 
 
303 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  56.36 
 
 
288 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  63.01 
 
 
321 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  56.21 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  52.94 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  50.17 
 
 
294 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  53.11 
 
 
312 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  53.11 
 
 
312 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  53.11 
 
 
312 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  48.22 
 
 
399 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  49.01 
 
 
300 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  48.53 
 
 
300 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  48.53 
 
 
300 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  48.53 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  47.9 
 
 
399 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  47.9 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  54.06 
 
 
304 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  48.21 
 
 
300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  53.45 
 
 
336 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  48.21 
 
 
300 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  47.7 
 
 
299 aa  269  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  53.52 
 
 
311 aa  268  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  55.07 
 
 
298 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  55.36 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  45.56 
 
 
299 aa  229  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  44.62 
 
 
258 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  41.6 
 
 
246 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  46.31 
 
 
262 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  43.67 
 
 
255 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  40.73 
 
 
355 aa  175  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  50.43 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  42.47 
 
 
257 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 
243 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  43.5 
 
 
253 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  40.33 
 
 
250 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  43.75 
 
 
239 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  44.17 
 
 
324 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 
243 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  44.58 
 
 
325 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 
392 aa  165  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  40.73 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  43.11 
 
 
312 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  37.45 
 
 
498 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  38.74 
 
 
364 aa  155  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  42.17 
 
 
325 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  42.68 
 
 
255 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  39.02 
 
 
335 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  39.24 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  49.57 
 
 
305 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  35.08 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  28.64 
 
 
259 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  28.64 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  31.77 
 
 
263 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  28.14 
 
 
259 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  23.65 
 
 
257 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.31 
 
 
257 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  28.79 
 
 
280 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.67 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.78 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  24.45 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  28.04 
 
 
268 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  27.78 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  27.06 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  29.21 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  26.92 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  22.69 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  25.83 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  30.52 
 
 
250 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  28.45 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  27.06 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  27.06 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  26.29 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  27.06 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  28.45 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  27.06 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  27.06 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  27.06 
 
 
256 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  26.44 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  28.45 
 
 
256 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  27.81 
 
 
255 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  33.01 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  27.51 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  28.42 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  31.43 
 
 
263 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  25.81 
 
 
255 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>