120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4933 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
319 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  74.67 
 
 
307 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  67.52 
 
 
317 aa  358  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  63.92 
 
 
319 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  67.2 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  67.71 
 
 
333 aa  347  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  65.82 
 
 
315 aa  346  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  66.11 
 
 
312 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  61.56 
 
 
319 aa  320  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  58.54 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  62.91 
 
 
320 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  50.32 
 
 
369 aa  285  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  50.96 
 
 
300 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  50.96 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  50.64 
 
 
399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  51.5 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  50.64 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  52 
 
 
299 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  50.64 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  50.32 
 
 
300 aa  281  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  49.68 
 
 
300 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  50.64 
 
 
300 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  57.88 
 
 
288 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  60.07 
 
 
321 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  54.17 
 
 
295 aa  271  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  56.61 
 
 
293 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  50.99 
 
 
312 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  50.99 
 
 
312 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  50.99 
 
 
312 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  50.16 
 
 
311 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  52.72 
 
 
303 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  51.06 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  51.83 
 
 
298 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  54.55 
 
 
298 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  45.42 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  41.6 
 
 
246 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  45.42 
 
 
262 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  43.7 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  44.92 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  49.58 
 
 
300 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  42.51 
 
 
243 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  40.65 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  43.98 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 
243 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  43.57 
 
 
325 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  43.98 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 
392 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  41.43 
 
 
257 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  40.64 
 
 
355 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  40.6 
 
 
335 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  42.99 
 
 
253 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  41.41 
 
 
312 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  39.31 
 
 
364 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  44.07 
 
 
255 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  38.33 
 
 
295 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  37.8 
 
 
498 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  41.42 
 
 
325 aa  142  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  50.42 
 
 
305 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  35.91 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  24.64 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.67 
 
 
263 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  27.62 
 
 
263 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  28.99 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  27.38 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  26.89 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  26.54 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  27.38 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  27.91 
 
 
257 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  27.91 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  28.37 
 
 
263 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  28.4 
 
 
256 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  27.12 
 
 
263 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  27.22 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  27.36 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  25.64 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  27.96 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  25.64 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  31.06 
 
 
255 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  25.48 
 
 
266 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  27.08 
 
 
264 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  29.14 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  32.86 
 
 
261 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  22.27 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  28.48 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  24.62 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  25.71 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  25.31 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  29.55 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  27.4 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  25.25 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  32.39 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>