240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4780 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  63.64 
 
 		 188 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  50.79 
 
 		 193 aa  205  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  48.96 
 
 		 498 aa  194  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  47.4 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1506  siroheme synthase  47.09 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  43.03 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  35.93 
 
 		 246 aa  111  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  44.68 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  42.36 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  35.76 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  37.72 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  35.33 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.95 
 
 		 479 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  33.51 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.26 
 
 		 303 aa  98.2  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  35.37 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  33.91 
 
 		 249 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.92 
 
 		 626 aa  95.5  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  34.68 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06710  siroheme synthase Met8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05680)  32.53 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.15 
 
 		 554 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  31.14 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.15 
 
 		 528 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  35.12 
 
 		 306 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  36.6 
 
 		 306 aa  92  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.29 
 
 		 303 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.75 
 
 		 462 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  31.93 
 
 		 255 aa  91.7  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.67 
 
 		 489 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  36.36 
 
 		 303 aa  91.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  28.74 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  33.33 
 
 		 303 aa  91.3  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  31.52 
 
 		 468 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  32.14 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.64 
 
 		 462 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.73 
 
 		 487 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.75 
 
 		 473 aa  89.4  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  32.7 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  38.56 
 
 		 472 aa  89.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  40.97 
 
 		 220 aa  88.6  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  34.93 
 
 		 257 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  30.95 
 
 		 464 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  32.95 
 
 		 312 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.82 
 
 		 502 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  30.5 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00750  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 		 310 aa  85.9  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  29.45 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  32.24 
 
 		 161 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.71 
 
 		 480 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  29.1 
 
 		 473 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  29.1 
 
 		 473 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  34.68 
 
 		 303 aa  85.1  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  33.91 
 
 		 457 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  33.99 
 
 		 303 aa  84.7  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.43 
 
 		 493 aa  84.7  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  35.95 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  31.58 
 
 		 157 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  35.48 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  35.95 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  28.05 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  35.95 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  33.99 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  30.92 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  29.24 
 
 		 464 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  30.92 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  33.1 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  35.48 
 
 		 474 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  35.29 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  30.23 
 
 		 459 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  30.92 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.06 
 
 		 472 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  30.92 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.59 
 
 		 464 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  32.34 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  29.65 
 
 		 459 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  33.33 
 
 		 457 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  33.33 
 
 		 457 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 457 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  28.95 
 
 		 470 aa  81.3  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  33.33 
 
 		 457 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  33.33 
 
 		 457 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  33.33 
 
 		 457 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  30.92 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  29.65 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  30.92 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  31.58 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  35.29 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  31.58 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  33.99 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.27 
 
 		 480 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  32.76 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  31.79 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.88 
 
 		 470 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  29.63 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  34.9 
 
 		 462 aa  78.6  0.00000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  30.26 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  33.99 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  31.37 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>