249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0710 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  100 
 
 		 148 aa  291  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  40.14 
 
 		 626 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  34.72 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  34.29 
 
 		 218 aa  97.1  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  32.64 
 
 		 214 aa  97.1  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0049  porphyrin biosynthesis protein, putative  30.56 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.843521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  32.17 
 
 		 257 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  35.66 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  36.62 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  31.29 
 
 		 468 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  36.3 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  34.01 
 
 		 462 aa  92.4  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  31.29 
 
 		 321 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  39.16 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  32.89 
 
 		 303 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  33.33 
 
 		 193 aa  90.9  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.25 
 
 		 213 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  32.65 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  32.89 
 
 		 306 aa  88.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2300  siroheme synthase  39.86 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000117051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  35.42 
 
 		 212 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  28.67 
 
 		 209 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  31.91 
 
 		 280 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  31.25 
 
 		 195 aa  87.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  30.61 
 
 		 303 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  29.93 
 
 		 303 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  29.53 
 
 		 200 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  33.56 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  32.19 
 
 		 224 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  29.37 
 
 		 226 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  31.54 
 
 		 306 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.57 
 
 		 476 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  30.52 
 
 		 208 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  31.76 
 
 		 312 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.61 
 
 		 462 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.65 
 
 		 479 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  34.23 
 
 		 212 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  30.61 
 
 		 303 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.41 
 
 		 462 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.93 
 
 		 472 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  29.93 
 
 		 472 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  29.93 
 
 		 472 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  31.76 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  31.25 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  31.54 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  31.51 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  31.76 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  33.55 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.25 
 
 		 473 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  30 
 
 		 498 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.93 
 
 		 472 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  36.55 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  34.48 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.25 
 
 		 480 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.25 
 
 		 480 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1704  siroheme synthase  35.71 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  28.57 
 
 		 464 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  27.21 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.78 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  33.11 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.78 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  31.76 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.78 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  28.57 
 
 		 465 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  27.7 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.53 
 
 		 493 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  28.57 
 
 		 465 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  27.7 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  25.85 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  34.27 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  31.37 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  26.53 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  27.03 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  25.85 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  28.57 
 
 		 464 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  25.85 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  25.85 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.97 
 
 		 482 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  32.87 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.89 
 
 		 464 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  27.21 
 
 		 303 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0042  porphyrin biosynthesis protein, putative  30.14 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  27.86 
 
 		 221 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  33.1 
 
 		 407 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  28.28 
 
 		 198 aa  77.4  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.76 
 
 		 528 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.61 
 
 		 554 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  21.85 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  25.17 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  27.21 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  25.17 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  25.85 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.8 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.33 
 
 		 473 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.89 
 
 		 489 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  29.53 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  34.03 
 
 		 474 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.86 
 
 		 502 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  29.2 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  32.82 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>