More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0537 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  100 
 
 		 321 aa  658    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  45.07 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.6 
 
 		 462 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  38.61 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.23 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.74 
 
 		 476 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.54 
 
 		 464 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.48 
 
 		 528 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.31 
 
 		 502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.62 
 
 		 482 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.27 
 
 		 473 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  35.71 
 
 		 462 aa  209  3e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.77 
 
 		 487 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  37.62 
 
 		 472 aa  205  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  37.62 
 
 		 472 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.62 
 
 		 472 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.49 
 
 		 458 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.6 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  36.27 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.86 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  37.42 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.5 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.94 
 
 		 464 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  37.42 
 
 		 465 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.7 
 
 		 489 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.56 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  36.27 
 
 		 464 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.73 
 
 		 554 aa  200  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.85 
 
 		 495 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.51 
 
 		 463 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.77 
 
 		 482 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.57 
 
 		 462 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  38.31 
 
 		 459 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.19 
 
 		 464 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.86 
 
 		 463 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.86 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.41 
 
 		 479 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  35.99 
 
 		 473 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  35.99 
 
 		 473 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  36.84 
 
 		 472 aa  185  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  35.67 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  37.5 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  36.46 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.55 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  36.46 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  35.99 
 
 		 470 aa  179  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.19 
 
 		 473 aa  176  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  33.14 
 
 		 457 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  34.71 
 
 		 467 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  33.14 
 
 		 457 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  32.84 
 
 		 457 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  34.44 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  32.84 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  32.84 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.66 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  36.16 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  36.09 
 
 		 457 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  31.67 
 
 		 457 aa  165  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  31.38 
 
 		 457 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  31.38 
 
 		 457 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  31.38 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.38 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  31.38 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  31.38 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  31.38 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  31.38 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.19 
 
 		 478 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.96 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  35.18 
 
 		 476 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.55 
 
 		 478 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.24 
 
 		 484 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.59 
 
 		 478 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  33.66 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.03 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.13 
 
 		 478 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.97 
 
 		 476 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.21 
 
 		 478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  29.62 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  34.06 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.61 
 
 		 478 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4522  siroheme synthase  29.62 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1671  siroheme synthase  29.9 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105367  normal  0.362016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  32.83 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  28.7 
 
 		 485 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.65 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  30.71 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.6 
 
 		 476 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.33 
 
 		 480 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  32.84 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  32.09 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.71 
 
 		 473 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  36.41 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  30.99 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  31.34 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  30.99 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  31.94 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  30.63 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.4 
 
 		 475 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  29.48 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  28.39 
 
 		 493 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>