More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0970 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.94 
 
 		 476 aa  701    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.53 
 
 		 473 aa  685    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  100 
 
 		 472 aa  947    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  99.58 
 
 		 472 aa  944    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.46 
 
 		 480 aa  716    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.88 
 
 		 472 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  99.58 
 
 		 472 aa  944    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  75.83 
 
 		 480 aa  711    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  64.33 
 
 		 462 aa  593  1e-168  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  54.98 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  54.55 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  54.51 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  54.51 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  56.3 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.3 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  56.3 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  56.3 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  56.3 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  56.3 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  56.3 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  55.87 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  56.09 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  54.07 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  53.71 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  54.49 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  54.13 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  54.27 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  54.13 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  54.25 
 
 		 459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  54.8 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.27 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  53.06 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  54.8 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  52.83 
 
 		 457 aa  461  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  53.39 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.39 
 
 		 502 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  53.39 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.17 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  52.15 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  54.27 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.85 
 
 		 482 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  48.72 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.26 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.95 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.36 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  49.02 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.74 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.52 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.13 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.74 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.83 
 
 		 528 aa  431  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  50.33 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.83 
 
 		 554 aa  418  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.49 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.02 
 
 		 482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.55 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  48.4 
 
 		 474 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.18 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.15 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.03 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 		 478 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  45.75 
 
 		 476 aa  360  4e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.33 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.77 
 
 		 478 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.98 
 
 		 476 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.13 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.58 
 
 		 478 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.54 
 
 		 476 aa  333  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.59 
 
 		 480 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2138  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.99 
 
 		 299 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.73 
 
 		 478 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  61.57 
 
 		 295 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.15 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00765  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.78 
 
 		 296 aa  299  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.73 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.18 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.49 
 
 		 480 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0347  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.69 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.354994 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.98 
 
 		 276 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.02 
 
 		 276 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.02 
 
 		 276 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.62 
 
 		 490 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  41.42 
 
 		 493 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3418  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.01 
 
 		 485 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  56.33 
 
 		 275 aa  289  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.19 
 
 		 273 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  41.71 
 
 		 477 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.97 
 
 		 276 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.54 
 
 		 269 aa  285  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.38 
 
 		 273 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.54 
 
 		 278 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  41.47 
 
 		 478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.86 
 
 		 281 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.86 
 
 		 281 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.14 
 
 		 277 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.68 
 
 		 269 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.86 
 
 		 278 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 		 490 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.54 
 
 		 272 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>