224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0042 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0042  porphyrin biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  69.39 
 
 		 149 aa  224  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  72.73 
 
 		 153 aa  223  9e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  68.31 
 
 		 149 aa  216  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  67.59 
 
 		 150 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  59.06 
 
 		 153 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0049  porphyrin biosynthesis protein, putative  45.45 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.843521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.1 
 
 		 626 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  36 
 
 		 213 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.01 
 
 		 487 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  34.25 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.46 
 
 		 528 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  34.4 
 
 		 218 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.13 
 
 		 554 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  30.34 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  33.33 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  32.62 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.03 
 
 		 493 aa  77  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  30.14 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  32.41 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  31.58 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  29.5 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  28.08 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.77 
 
 		 468 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  35.56 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  31.76 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  29.53 
 
 		 213 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  35.17 
 
 		 280 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  31.79 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  29.05 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  30.26 
 
 		 188 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.21 
 
 		 489 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  32.37 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  30.61 
 
 		 312 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 462 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  31.08 
 
 		 306 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 		 502 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  31.97 
 
 		 306 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  28.28 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  27.34 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  30.5 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.08 
 
 		 470 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  30.14 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  30.14 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  30.94 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  28.46 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  32.31 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  29.14 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  26.24 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  26.43 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.03 
 
 		 462 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  31.3 
 
 		 326 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2300  siroheme synthase  30.26 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000117051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  29.79 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  26.63 
 
 		 462 aa  65.9  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.47 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.38 
 
 		 464 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  27.13 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  31.72 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.81 
 
 		 394 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.97 
 
 		 480 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  30.82 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  28.17 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  29.6 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  26.24 
 
 		 257 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  26.9 
 
 		 472 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  28.26 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  27.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  28.78 
 
 		 212 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  30.17 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  25.14 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.35 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  27.66 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  31.72 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.27 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  31.25 
 
 		 465 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  28.37 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  28.48 
 
 		 498 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  31.25 
 
 		 465 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.05 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  27.14 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  26.95 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  28.24 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.21 
 
 		 473 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.15 
 
 		 473 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  28.37 
 
 		 303 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  26.95 
 
 		 303 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  26.95 
 
 		 303 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  31.25 
 
 		 464 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  28 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  27.27 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  27.27 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  26.95 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.33 
 
 		 800 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  28.68 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  26.9 
 
 		 472 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  26.9 
 
 		 472 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.56 
 
 		 422 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.9 
 
 		 472 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.35 
 
 		 420 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>