270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3617 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.5 
 
 		 489 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  37.56 
 
 		 459 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.29 
 
 		 487 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  40.36 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  36.04 
 
 		 459 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  38.64 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.18 
 
 		 554 aa  121  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  37.91 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.51 
 
 		 528 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.86 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  40.85 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.3 
 
 		 495 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.32 
 
 		 493 aa  118  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  118  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.51 
 
 		 472 aa  118  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  36.21 
 
 		 473 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  36.21 
 
 		 473 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  38.29 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.38 
 
 		 484 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  35.45 
 
 		 468 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  39.52 
 
 		 224 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.4 
 
 		 482 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  33.8 
 
 		 459 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  33.8 
 
 		 457 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  36.07 
 
 		 457 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  33.8 
 
 		 457 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  33.8 
 
 		 457 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  36.07 
 
 		 457 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.07 
 
 		 457 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  36.07 
 
 		 457 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  36.07 
 
 		 457 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  36.07 
 
 		 457 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  36.07 
 
 		 457 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  33.33 
 
 		 457 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  36.07 
 
 		 457 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  31.28 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  36.21 
 
 		 467 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  34.74 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  35.52 
 
 		 457 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.18 
 
 		 464 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.36 
 
 		 480 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  31.69 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  34.33 
 
 		 314 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.93 
 
 		 473 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.32 
 
 		 502 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.64 
 
 		 303 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  33.98 
 
 		 457 aa  111  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  39.43 
 
 		 462 aa  111  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.01 
 
 		 476 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  35.05 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.63 
 
 		 480 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  37.36 
 
 		 465 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  37.36 
 
 		 465 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  35.06 
 
 		 470 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  36.42 
 
 		 472 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.42 
 
 		 472 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  36.42 
 
 		 472 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.93 
 
 		 462 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  34.97 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  38.15 
 
 		 228 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  32.34 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  38.81 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  32.04 
 
 		 312 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  35.06 
 
 		 472 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  38.92 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.47 
 
 		 481 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  33.92 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  39.88 
 
 		 474 aa  104  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  33.16 
 
 		 464 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  35.09 
 
 		 476 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  33.16 
 
 		 464 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.5 
 
 		 464 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.13 
 
 		 473 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  35.92 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  33.73 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  33.73 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  34.59 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  32.93 
 
 		 321 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  33.73 
 
 		 303 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  35.36 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  33.73 
 
 		 303 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.09 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  35.06 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.13 
 
 		 470 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  32.22 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.16 
 
 		 462 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.18 
 
 		 458 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  31.35 
 
 		 303 aa  101  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  32.6 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  31.69 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  34.91 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.12 
 
 		 626 aa  99.4  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  32.53 
 
 		 303 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  31.95 
 
 		 307 aa  98.6  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0961  siroheme synthase  34.43 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  36.09 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  30.16 
 
 		 303 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  37.93 
 
 		 326 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>