286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0400 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  100 
 
 
212 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  58.21 
 
 
280 aa  250  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  43.09 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  42.22 
 
 
213 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  38.89 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  39.46 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  38.92 
 
 
214 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  44.44 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  37.25 
 
 
204 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  37.25 
 
 
204 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  39.56 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  37.57 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  40.46 
 
 
212 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  36.97 
 
 
246 aa  138  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.04 
 
 
626 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  39.27 
 
 
255 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2697  precorrin-2 dehydrogenase  40.22 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2642  precorrin-2 dehydrogenase  40.22 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  38 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  42.13 
 
 
476 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  38.42 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
478 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  40.88 
 
 
200 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  37 
 
 
205 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  36.87 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  36.46 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  37.37 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  37.37 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  37.37 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  37.37 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  37.37 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  40.56 
 
 
157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  40.56 
 
 
157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  37.5 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  34.05 
 
 
230 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  37.08 
 
 
306 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  35 
 
 
257 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  40.85 
 
 
157 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  33.02 
 
 
225 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  40.85 
 
 
157 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  40.14 
 
 
157 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  40.14 
 
 
161 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  38.73 
 
 
156 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  39.57 
 
 
149 aa  121  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  37.91 
 
 
212 aa  121  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  34.87 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  40.14 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  33.33 
 
 
314 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  35.83 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  37.06 
 
 
157 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  42.59 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  34.83 
 
 
306 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.36 
 
 
800 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  33.87 
 
 
468 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.22 
 
 
502 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  40.62 
 
 
194 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.87 
 
 
473 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  35.26 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  33.52 
 
 
459 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  31.46 
 
 
321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  39.35 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  37.04 
 
 
459 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  36.02 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  39.33 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  32.95 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  33.18 
 
 
472 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.06 
 
 
480 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  33.8 
 
 
313 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  35.36 
 
 
326 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  31.46 
 
 
467 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.9 
 
 
493 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.86 
 
 
480 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  37.42 
 
 
224 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  34.54 
 
 
224 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  34.08 
 
 
220 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  30.73 
 
 
473 aa  104  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  30.73 
 
 
473 aa  104  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.07 
 
 
476 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  32.42 
 
 
247 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  34.25 
 
 
151 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.09 
 
 
473 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.02 
 
 
472 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  32.43 
 
 
226 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.97 
 
 
778 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  35.12 
 
 
221 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  30.94 
 
 
307 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  34.39 
 
 
470 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.37 
 
 
489 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.53 
 
 
837 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  31.82 
 
 
457 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  31.82 
 
 
457 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  31.82 
 
 
459 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  31.82 
 
 
457 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  31.25 
 
 
457 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  30.93 
 
 
462 aa  100  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.73 
 
 
479 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  35.33 
 
 
195 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.09 
 
 
495 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  31.19 
 
 
228 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  30.35 
 
 
303 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>