247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2697 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2697  precorrin-2 dehydrogenase  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2642  precorrin-2 dehydrogenase  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  54.55 
 
 
203 aa  216  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  40.22 
 
 
212 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  39.09 
 
 
204 aa  141  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  37.06 
 
 
205 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  38.58 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  38.69 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  35.82 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  38.69 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.38 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  38.69 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  38.69 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  38.69 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  38.69 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  38.69 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  36.04 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  32.68 
 
 
213 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  32.79 
 
 
209 aa  111  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  32.81 
 
 
212 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  34.16 
 
 
224 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  39.16 
 
 
157 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  30.93 
 
 
225 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  33.33 
 
 
235 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  31.55 
 
 
214 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  39.16 
 
 
157 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  37.76 
 
 
161 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  38.46 
 
 
149 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  39.16 
 
 
156 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  38.46 
 
 
157 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  32.52 
 
 
468 aa  101  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  36.36 
 
 
157 aa  101  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  36.36 
 
 
157 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  37.76 
 
 
157 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  37.76 
 
 
157 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  34.78 
 
 
224 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.5 
 
 
472 aa  97.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  28.5 
 
 
472 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  28.5 
 
 
472 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  30.82 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  26.7 
 
 
257 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  33.95 
 
 
246 aa  95.5  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.53 
 
 
480 aa  94.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  30.77 
 
 
151 aa  94.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  31.48 
 
 
255 aa  94.4  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.53 
 
 
480 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.41 
 
 
473 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  35.76 
 
 
306 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  30.06 
 
 
462 aa  92.8  3e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  30.26 
 
 
473 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  29.94 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  30.26 
 
 
473 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  29.1 
 
 
303 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  31.1 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  30.73 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  30.65 
 
 
229 aa  92  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.89 
 
 
626 aa  91.7  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.72 
 
 
472 aa  90.5  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.54 
 
 
502 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  34.55 
 
 
306 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  34.15 
 
 
312 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  30.77 
 
 
470 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  28.06 
 
 
457 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  27.84 
 
 
314 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  32.32 
 
 
476 aa  89  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  28.4 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  28.06 
 
 
459 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  28.06 
 
 
457 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  27.41 
 
 
457 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.32 
 
 
478 aa  88.2  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  27.55 
 
 
457 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  27.41 
 
 
457 aa  87.8  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  27.41 
 
 
457 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  27.41 
 
 
457 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.41 
 
 
457 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  27.41 
 
 
457 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  27.41 
 
 
457 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  27.41 
 
 
457 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  27.41 
 
 
457 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  27.41 
 
 
457 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.83 
 
 
476 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  28.22 
 
 
303 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  27.55 
 
 
457 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  31.52 
 
 
465 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  34.25 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  30.91 
 
 
465 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  26.53 
 
 
182 aa  85.5  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  27.59 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  26.01 
 
 
226 aa  85.1  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  31.69 
 
 
249 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  28.83 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  30.67 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  29.75 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.74 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  30.06 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  29.79 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  26.06 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  32.8 
 
 
142 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  32.87 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  25.37 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>