259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1669 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  41.58 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  44.04 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  45.77 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  39.61 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  41.4 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  36.11 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  37.84 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  36.9 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.76 
 
 		 213 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  39.55 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  40.5 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  43.56 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  41.67 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  33.69 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  36.96 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  33.01 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  34.11 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  36.14 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  33.15 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  34.34 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  34.25 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.11 
 
 		 480 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.57 
 
 		 480 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  33.15 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.55 
 
 		 476 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  35.32 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  33 
 
 		 212 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.55 
 
 		 473 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  39.38 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  32.28 
 
 		 473 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  32.28 
 
 		 473 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  32.42 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.32 
 
 		 462 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  32.52 
 
 		 467 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.89 
 
 		 472 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  34.43 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  32.8 
 
 		 470 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 472 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  28.92 
 
 		 462 aa  100  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  33.33 
 
 		 472 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  29.41 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  33.33 
 
 		 472 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  35.75 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  31.15 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.86 
 
 		 626 aa  99  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.18 
 
 		 495 aa  98.6  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.82 
 
 		 478 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  36.32 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  32.82 
 
 		 476 aa  96.7  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.22 
 
 		 800 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.78 
 
 		 493 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  31.68 
 
 		 205 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.19 
 
 		 468 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  29.74 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  41.94 
 
 		 194 aa  92  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  29.26 
 
 		 314 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  28.64 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  35.58 
 
 		 197 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  32.49 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  33.68 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  29.83 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  28.33 
 
 		 321 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.2 
 
 		 502 aa  89  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  30.52 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  28.84 
 
 		 457 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  28.84 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  28.84 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  28.84 
 
 		 459 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  28.84 
 
 		 457 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  28.77 
 
 		 459 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  27.27 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  29.63 
 
 		 457 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  29.38 
 
 		 182 aa  86.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  27.27 
 
 		 303 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  27.27 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.86 
 
 		 481 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  28.66 
 
 		 204 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  28.66 
 
 		 204 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  29.63 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  30.17 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  29.63 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  29.63 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.63 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  29.63 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  30.18 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  29.63 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  29.63 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  29.63 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  27.06 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  29.08 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.06 
 
 		 778 aa  82.4  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  29.1 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.54 
 
 		 837 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  30.06 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  25.67 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  25.67 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  25.67 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  25.67 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  25.67 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>