235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1461 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  51.4 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  40.98 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  41.04 
 
 		 208 aa  141  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  39.9 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  32.21 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  36.84 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  34.1 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  33.71 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  30.23 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  31.53 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  31.37 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  32.62 
 
 		 472 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.16 
 
 		 472 aa  95.5  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  32.62 
 
 		 472 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.24 
 
 		 502 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.09 
 
 		 472 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  36.26 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1220  siroheme synthase  29.58 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.43 
 
 		 626 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.98 
 
 		 462 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.75 
 
 		 473 aa  91.7  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  30.05 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  33.68 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.37 
 
 		 464 aa  89  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.14 
 
 		 487 aa  88.2  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  30.58 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  30.11 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  29.84 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.86 
 
 		 468 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  32.14 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  27.08 
 
 		 473 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  30.17 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  27.08 
 
 		 473 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  31.05 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  29.71 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  27.8 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  27.8 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  27.8 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.8 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  37.79 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.16 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  28.93 
 
 		 554 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  27.8 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  27.8 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  27.8 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  27.8 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  27.8 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  27.8 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  27.8 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  29.21 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  27.8 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.68 
 
 		 528 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  27.32 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  29.02 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  27.32 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  30.29 
 
 		 474 aa  81.6  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  31.32 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  27.51 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  30.21 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  33.77 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  33.52 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  28.04 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  28.04 
 
 		 465 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  27.08 
 
 		 470 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  28.65 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  25.24 
 
 		 467 aa  79  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  34 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  31.95 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  26.09 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  26.98 
 
 		 459 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.04 
 
 		 480 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  33.5 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  28.8 
 
 		 464 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  27.69 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  28.71 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  31.1 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.81 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  29.32 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  29.33 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  28.93 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  30.64 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  27.87 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  31.21 
 
 		 476 aa  76.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  28.88 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.05 
 
 		 493 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.13 
 
 		 481 aa  75.9  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  29.32 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.19 
 
 		 464 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  29.61 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  27.32 
 
 		 464 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.14 
 
 		 458 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  25.98 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  28.43 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  26.89 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.64 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  28.83 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  32.26 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  25.91 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  28.34 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>