197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1220 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1220  siroheme synthase  100 
 
 
238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  69.96 
 
 
218 aa  291  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  57.39 
 
 
215 aa  236  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  50.87 
 
 
216 aa  204  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  51.05 
 
 
225 aa  180  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  33.33 
 
 
208 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  37.74 
 
 
208 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  30.84 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  36.9 
 
 
206 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  32.34 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  28.15 
 
 
459 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  28.99 
 
 
459 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.66 
 
 
502 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  29.36 
 
 
204 aa  82  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  28.11 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  28.69 
 
 
457 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  29.63 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  30.33 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  28.69 
 
 
457 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  28.69 
 
 
459 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  27.27 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  27.27 
 
 
457 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  28.28 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  27.27 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.27 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.65 
 
 
472 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  27.27 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  27.27 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  27.27 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  27.27 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  30.65 
 
 
472 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  30.65 
 
 
472 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.14 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  26.86 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.93 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.05 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.56 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  29.36 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  29.36 
 
 
465 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  26.69 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.64 
 
 
464 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  23.85 
 
 
473 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  30.33 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  32.04 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  23.85 
 
 
473 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.43 
 
 
528 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.92 
 
 
464 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  31.05 
 
 
198 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.66 
 
 
472 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  27.94 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.55 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  27.43 
 
 
457 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  39.29 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.3 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.64 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.77 
 
 
554 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  26.7 
 
 
464 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.09 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.18 
 
 
470 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  27.88 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  26.21 
 
 
464 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  26.27 
 
 
468 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  27.27 
 
 
472 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.39 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  27.78 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  27.51 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.01 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  23.46 
 
 
470 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  30.18 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  25.43 
 
 
489 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  29.89 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  30.58 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  25.46 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  30.37 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  28.38 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  29.61 
 
 
476 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.26 
 
 
467 aa  62.4  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  24.77 
 
 
306 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.29 
 
 
479 aa  62.4  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  23.38 
 
 
195 aa  62  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.89 
 
 
493 aa  62.4  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.47 
 
 
482 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.78 
 
 
478 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.37 
 
 
626 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  23.65 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  24.63 
 
 
201 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  24.63 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  26.26 
 
 
303 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.25 
 
 
482 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  23.38 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  22.94 
 
 
148 aa  58.9  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  29.34 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.57 
 
 
481 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  24.14 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  25.6 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.48 
 
 
463 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 
463 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  26.09 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 
463 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  26 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>