210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1613 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  100 
 
 
215 aa  414  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  64.02 
 
 
218 aa  240  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1220  siroheme synthase  57.39 
 
 
238 aa  231  9e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  53.08 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  58.37 
 
 
225 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  32.67 
 
 
224 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  36.1 
 
 
208 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  37.63 
 
 
208 aa  99  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  32.54 
 
 
459 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.38 
 
 
470 aa  88.6  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  34.95 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  36.08 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.46 
 
 
502 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.05 
 
 
480 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  34.26 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.41 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.97 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  30.62 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  34.21 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  29.8 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.99 
 
 
464 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  33.51 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.56 
 
 
489 aa  78.6  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  31.05 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  32.35 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.47 
 
 
626 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  27.35 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.11 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  29.63 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  30.34 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  27.35 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  27.35 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.35 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  31.94 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  27.35 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  26.91 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  27.35 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  27.35 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  27.35 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
476 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.54 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  29.14 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  32.45 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.04 
 
 
472 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  32.04 
 
 
472 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  34.34 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  34.27 
 
 
465 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  32.04 
 
 
472 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.95 
 
 
462 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  27.86 
 
 
473 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  27.86 
 
 
473 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35 
 
 
493 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  31.61 
 
 
462 aa  74.7  0.0000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  30.93 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  34.27 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  30.27 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  29.51 
 
 
457 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.83 
 
 
528 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  29.51 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  30.93 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  29.51 
 
 
457 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  29.78 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.07 
 
 
482 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.37 
 
 
462 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  29.95 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  28.96 
 
 
457 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.44 
 
 
487 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  31.35 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  31.11 
 
 
464 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  33.73 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.28 
 
 
554 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.22 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  31.94 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  31.84 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  26.9 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  30.11 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  27.86 
 
 
470 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  31.53 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  28.21 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  31.03 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  34.54 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  33.55 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  30.97 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  31.53 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  37.74 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  26.28 
 
 
148 aa  68.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.61 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  30.11 
 
 
457 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.09 
 
 
482 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  31.03 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  31.03 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  31.03 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  31.03 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  28.82 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  33.53 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  31.03 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  29.82 
 
 
467 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  28.87 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  29.56 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  30 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>