132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0522 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  39.58 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  39.79 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  35.94 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  34.03 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  36.65 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  32.98 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  30.61 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  29.32 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  30.05 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1220  siroheme synthase  30.91 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  30.46 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  32.09 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  32.5 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  33.16 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0119  siroheme synthase  31.94 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  31.75 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1159  siroheme synthase  25.89 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.403167  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  27.84 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  31.58 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  29.95 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  28.95 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0053  siroheme synthase  25.82 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000804715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.15 
 
 		 462 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  30.53 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  25.71 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  27.03 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  27.48 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.45 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  24.57 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  30.2 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  30.2 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2248  siroheme synthase  30.3 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0893363  normal  0.464998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  28.64 
 
 		 465 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  28.66 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  28.64 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.65 
 
 		 464 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  29.24 
 
 		 472 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  30.87 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  29.23 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  31.58 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  30.87 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  30.87 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  28.95 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  30.2 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.78 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  28.86 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1506  siroheme synthase  26.82 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1731  siroheme synthase  29.8 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.381088  normal  0.846654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  27.69 
 
 		 306 aa  54.7  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  29.05 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  24.32 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  30.46 
 
 		 303 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  27.65 
 
 		 457 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  28.42 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  26.82 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  28.19 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  27.18 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  29.14 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  28.74 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  25.29 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.02 
 
 		 481 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  27.87 
 
 		 457 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  25.95 
 
 		 462 aa  52.4  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  28.19 
 
 		 457 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  28.19 
 
 		 457 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.19 
 
 		 457 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  28.19 
 
 		 457 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  28.19 
 
 		 457 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  28.19 
 
 		 457 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  28.82 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  28.19 
 
 		 457 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  28.19 
 
 		 457 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  30.26 
 
 		 303 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.67 
 
 		 468 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  30.14 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  29.23 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  28.49 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  26.7 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  27.52 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  27.52 
 
 		 303 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  26.88 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  32.77 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  26.2 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  27.52 
 
 		 457 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  26.14 
 
 		 457 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  26.14 
 
 		 459 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.82 
 
 		 487 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0961  siroheme synthase  25.54 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  26.97 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  24.61 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  25.4 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  25.53 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  25.57 
 
 		 457 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  26.74 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  27.32 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.43 
 
 		 464 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.78 
 
 		 502 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  28.57 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.49 
 
 		 528 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>