168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1088 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  90.55 
 
 		 201 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  89.05 
 
 		 201 aa  348  3e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  70.15 
 
 		 201 aa  273  9e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0053  siroheme synthase  37.37 
 
 		 307 aa  154  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000804715  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  34.03 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  30.41 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  29.84 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1159  siroheme synthase  29.23 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.403167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  27.27 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  25.26 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  25.26 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  25.26 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.26 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  25.26 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  25.26 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  25.26 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  25.26 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  25.26 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  27.89 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  24.77 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  29.84 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  24.4 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  25 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  25 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  25 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  24.5 
 
 		 457 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  28.26 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0119  siroheme synthase  27.36 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  25.26 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  23.65 
 
 		 457 aa  68.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  26.04 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  24.35 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  24.63 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0961  siroheme synthase  25.29 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  24.38 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  25 
 
 		 462 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.53 
 
 		 481 aa  65.1  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  24.37 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.23 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  27.45 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  22.28 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  22.28 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.53 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  24.86 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  23.81 
 
 		 465 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  23.2 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  23.96 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1731  siroheme synthase  26.67 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.381088  normal  0.846654 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  22.4 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  22.45 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  21.83 
 
 		 468 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  24.35 
 
 		 314 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  23.28 
 
 		 465 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0511  siroheme synthase  28.42 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  25.51 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.03 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  24.88 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  20.97 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.4 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.92 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  24.37 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  20 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  27.92 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  23.2 
 
 		 459 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  24.39 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.33 
 
 		 473 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.41 
 
 		 479 aa  58.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  20.86 
 
 		 472 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2248  siroheme synthase  24.75 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0893363  normal  0.464998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  22.58 
 
 		 472 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.58 
 
 		 472 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  22.58 
 
 		 472 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  24.08 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  20 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  28.29 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  25 
 
 		 474 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  23.28 
 
 		 326 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  24.71 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  22.68 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  23.24 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  22.75 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  26.2 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  23.42 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.13 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  23.4 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.58 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.28 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  22.96 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  22.34 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  23.74 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  23.87 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.93 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  24.34 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  20.32 
 
 		 495 aa  55.1  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  27.7 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  23.71 
 
 		 464 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  23.37 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  22.83 
 
 		 307 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  23.59 
 
 		 472 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>