175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1729 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  52.45 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  46.8 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  41.29 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  39.9 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  36.27 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  35.96 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  32.47 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  33.33 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  29.47 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  34.16 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  30 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  34.43 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1220  siroheme synthase  30.33 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  33.91 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  29.84 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  28.57 
 
 		 148 aa  72  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  29.86 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  30.16 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  31.02 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  28.19 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  31.25 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  28.08 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  27.84 
 
 		 459 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  29.38 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.95 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  32.87 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  32.46 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  26.74 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  33.16 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  33.57 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  27.72 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  36.43 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  27.66 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  26.8 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  26.8 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.56 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  26.8 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  26.8 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.8 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  32.39 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  26 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  26.8 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  31.84 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  26.8 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  26.8 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  26.8 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  26.03 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  25.64 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  34.72 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  25.64 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.48 
 
 		 480 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  26.71 
 
 		 157 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  26.71 
 
 		 157 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  26.24 
 
 		 457 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  31.82 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  25.33 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  25.84 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  25.84 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0961  siroheme synthase  50 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  24.87 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  27.37 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  35.77 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  30.16 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.28 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  26.8 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  26.29 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  30.06 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.29 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  30.71 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  30.29 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  26.29 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  32.02 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  26.29 
 
 		 459 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  25.25 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.18 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  26 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.64 
 
 		 476 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.43 
 
 		 473 aa  58.2  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  25.48 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  48.72 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  28.37 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  25.77 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  26.88 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.64 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  26.09 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  27.27 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  25.94 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  31.3 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.91 
 
 		 472 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  34.21 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  32.17 
 
 		 464 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  26.43 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  31.67 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  31.67 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  31.67 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  31.67 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  28.96 
 
 		 465 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  28.96 
 
 		 465 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>