246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2188 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2697  precorrin-2 dehydrogenase  54.55 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2642  precorrin-2 dehydrogenase  54.55 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  39.46 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  37 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  38.12 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  36.5 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  36.5 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  36.5 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  37 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  37 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  37 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  37 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  37 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  32.97 
 
 		 280 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  36.5 
 
 		 205 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  32.65 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  29.95 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  26.5 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  31.46 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  29.95 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.4 
 
 		 626 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  29.41 
 
 		 246 aa  98.2  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  30.67 
 
 		 235 aa  97.8  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  30.67 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  30.67 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  30.06 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  28.65 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  29.63 
 
 		 255 aa  94  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  27.41 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  30.72 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  28.65 
 
 		 218 aa  91.3  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  31.93 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  28.73 
 
 		 314 aa  88.2  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  29.08 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  31.71 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.06 
 
 		 470 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  30.3 
 
 		 476 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.3 
 
 		 478 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  27.61 
 
 		 468 aa  84.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  22.5 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  30.18 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  28.32 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  29.17 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  30.22 
 
 		 249 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2129  siroheme synthase  34.69 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  23.53 
 
 		 303 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  28.02 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.51 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.67 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  26.42 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  28.35 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  32.37 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  32.61 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  24.73 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.44 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  24.73 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  24.73 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.37 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  26.42 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  32.37 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  27.27 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  29.88 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  32.61 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  28.66 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  24.18 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  28.22 
 
 		 459 aa  78.6  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  31.47 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  28.66 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  31.88 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  27.78 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  32.84 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  26.25 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.34 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  30.07 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  26.29 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  30.99 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  27.44 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  29.27 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  30.99 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.51 
 
 		 472 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  29.33 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  29.32 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  24.21 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  30.99 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  26.71 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.95 
 
 		 481 aa  75.5  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  26.58 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  30.99 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  25.16 
 
 		 303 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  32.82 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.6 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  28.57 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0961  siroheme synthase  24.52 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  28.05 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  26.82 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.08 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>