255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2129 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2129  siroheme synthase  100 
 
 
188 aa  347  6e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  38.89 
 
 
468 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  35.37 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  31.55 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  38.03 
 
 
472 aa  92  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  38.62 
 
 
306 aa  90.9  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  42.34 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  36.94 
 
 
306 aa  89  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  41.25 
 
 
197 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  35.66 
 
 
212 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  39.86 
 
 
214 aa  87.8  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  36.36 
 
 
470 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  36.36 
 
 
473 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  36.36 
 
 
473 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  43.84 
 
 
235 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  40.6 
 
 
280 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  38.73 
 
 
313 aa  85.5  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  26.7 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.1 
 
 
476 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.85 
 
 
493 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  37.06 
 
 
467 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.24 
 
 
480 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.14 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.43 
 
 
626 aa  80.5  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.42 
 
 
480 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  35.63 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  39.74 
 
 
465 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.03 
 
 
800 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  34.51 
 
 
462 aa  79.3  0.00000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  32.12 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  34.03 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  26.81 
 
 
157 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  26.81 
 
 
157 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  41.07 
 
 
224 aa  79  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  39.72 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  37.5 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  39.1 
 
 
465 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  38.12 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  40.91 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  35.56 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  34.03 
 
 
459 aa  77.8  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  26.62 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  26.62 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  38.75 
 
 
224 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  26.62 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  36.84 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  35.56 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.34 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  26.62 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  26.62 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.98 
 
 
472 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  31.68 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  36.09 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.57 
 
 
554 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  26.62 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  36.54 
 
 
472 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  36.09 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.87 
 
 
528 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.84 
 
 
482 aa  75.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  36.54 
 
 
472 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.03 
 
 
487 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  34.48 
 
 
312 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  35.9 
 
 
464 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.27 
 
 
464 aa  74.7  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  36.48 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.51 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  33.1 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.73 
 
 
473 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  35.9 
 
 
464 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  37.12 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  37.12 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  37.12 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  37.12 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  37.12 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.09 
 
 
455 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525458  normal  0.155845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  25.9 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  41.22 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  25.18 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.53 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  28.99 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.54 
 
 
464 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  36.7 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.48 
 
 
778 aa  71.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.36 
 
 
418 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  34.36 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  40.27 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.74 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  33.62 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  28.47 
 
 
148 aa  70.9  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  30.95 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.1 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.12 
 
 
495 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  31.62 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  34.27 
 
 
457 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  35.92 
 
 
457 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  23.56 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2300  siroheme synthase  26.95 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000117051  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  30.47 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  36.5 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  35.92 
 
 
457 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>