More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0572 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.75 
 
 
778 aa  911    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  70.81 
 
 
837 aa  1095    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
800 aa  1578    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  42.2 
 
 
561 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  36.26 
 
 
663 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.36 
 
 
623 aa  353  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.52 
 
 
623 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.76 
 
 
631 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.62 
 
 
629 aa  344  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  40.03 
 
 
579 aa  327  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.88 
 
 
867 aa  327  8.000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  37.79 
 
 
655 aa  326  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  38.19 
 
 
537 aa  321  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.87 
 
 
577 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  34.81 
 
 
620 aa  310  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.74 
 
 
574 aa  307  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.96 
 
 
600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.61 
 
 
600 aa  300  9e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.8 
 
 
593 aa  298  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  32.7 
 
 
593 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.92 
 
 
612 aa  292  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  37.09 
 
 
594 aa  290  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.47 
 
 
611 aa  290  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.37 
 
 
604 aa  287  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  31.79 
 
 
606 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.21 
 
 
601 aa  252  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.01 
 
 
547 aa  250  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  33.68 
 
 
574 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.01 
 
 
958 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  49.38 
 
 
468 aa  236  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.56 
 
 
472 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  50.39 
 
 
331 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  48.4 
 
 
423 aa  234  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.18 
 
 
810 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  34.64 
 
 
564 aa  233  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  34.64 
 
 
581 aa  232  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.61 
 
 
469 aa  230  8e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  32.25 
 
 
567 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  46.47 
 
 
329 aa  227  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  46.47 
 
 
329 aa  227  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  32.87 
 
 
566 aa  226  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.37 
 
 
572 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.1 
 
 
451 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.04 
 
 
596 aa  224  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.41 
 
 
777 aa  223  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.79 
 
 
331 aa  223  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.86 
 
 
563 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.65 
 
 
567 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.47 
 
 
258 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  52 
 
 
327 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.73 
 
 
577 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.95 
 
 
253 aa  221  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.85 
 
 
257 aa  220  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  49.41 
 
 
458 aa  220  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  37.84 
 
 
579 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.14 
 
 
569 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.14 
 
 
569 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.4 
 
 
520 aa  220  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.72 
 
 
329 aa  218  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  47.6 
 
 
326 aa  217  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.83 
 
 
328 aa  218  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  43.79 
 
 
772 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  36 
 
 
568 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.56 
 
 
263 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  47.43 
 
 
776 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.97 
 
 
565 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  51.84 
 
 
797 aa  214  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.66 
 
 
560 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.06 
 
 
240 aa  212  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.16 
 
 
284 aa  211  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.04 
 
 
243 aa  209  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  32.82 
 
 
567 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.06 
 
 
571 aa  207  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.76 
 
 
572 aa  207  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  46.4 
 
 
287 aa  207  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.28 
 
 
240 aa  203  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.89 
 
 
236 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.53 
 
 
240 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.04 
 
 
240 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.53 
 
 
240 aa  201  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.71 
 
 
264 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.62 
 
 
241 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.62 
 
 
241 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.86 
 
 
236 aa  198  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.62 
 
 
241 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.62 
 
 
241 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.64 
 
 
259 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.11 
 
 
560 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  42.62 
 
 
241 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.21 
 
 
241 aa  197  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  42.8 
 
 
238 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  51.23 
 
 
787 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.46 
 
 
481 aa  194  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.76 
 
 
435 aa  194  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.62 
 
 
244 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3119  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.82 
 
 
253 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.1 
 
 
595 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.49 
 
 
242 aa  190  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  45.99 
 
 
258 aa  189  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.53 
 
 
512 aa  187  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>