276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1980 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  100 
 
 		 194 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  42.35 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  51.33 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  49.39 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  47.43 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  45.75 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  50.31 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  46.54 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  40.62 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.23 
 
 		 626 aa  124  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  42.07 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  46.45 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  45.7 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  46.79 
 
 		 226 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  44.51 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  38.65 
 
 		 306 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  45 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  38.46 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  42.58 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  38.65 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  46.54 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  42.86 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  34.83 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  43.79 
 
 		 257 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  37.72 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  42.07 
 
 		 246 aa  114  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  43.56 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  41.83 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  39.38 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  38.51 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.15 
 
 		 493 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  37.66 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  40.13 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.31 
 
 		 489 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  38.78 
 
 		 312 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  43.71 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  41.94 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  36.77 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  43.36 
 
 		 468 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  36.02 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.41 
 
 		 495 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  37.74 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  47.17 
 
 		 224 aa  104  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  39.72 
 
 		 303 aa  104  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  37.32 
 
 		 303 aa  104  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.27 
 
 		 502 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  34.38 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.21 
 
 		 481 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  34.38 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  43.66 
 
 		 464 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.41 
 
 		 480 aa  101  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  38.3 
 
 		 303 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  38.3 
 
 		 303 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  38.3 
 
 		 303 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  36.65 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  36.62 
 
 		 303 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.06 
 
 		 464 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  28.22 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  34.13 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.14 
 
 		 458 aa  97.8  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  41.55 
 
 		 464 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  35.29 
 
 		 303 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  41.83 
 
 		 457 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.29 
 
 		 303 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  40.37 
 
 		 249 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  42.25 
 
 		 465 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  36.88 
 
 		 303 aa  96.3  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  41.83 
 
 		 457 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  32.85 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  41.83 
 
 		 459 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  36.62 
 
 		 307 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  42.25 
 
 		 465 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  37.32 
 
 		 303 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  37.32 
 
 		 303 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.38 
 
 		 462 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  39.74 
 
 		 457 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  37.32 
 
 		 303 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  37.32 
 
 		 303 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.74 
 
 		 467 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  34.76 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  41.18 
 
 		 457 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.9 
 
 		 554 aa  95.1  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.82 
 
 		 484 aa  95.5  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  35.4 
 
 		 303 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.43 
 
 		 464 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.9 
 
 		 528 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 473 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  39.16 
 
 		 472 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  35.62 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  35.62 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  35.62 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  38.46 
 
 		 457 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  35.62 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  35.62 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  40.69 
 
 		 457 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  35.62 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  28.3 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  40.69 
 
 		 457 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  40.69 
 
 		 457 aa  92  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.64 
 
 		 462 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>