254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2635 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  56.15 
 
 		 188 aa  217  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  50 
 
 		 498 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  53.76 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  47.4 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1506  siroheme synthase  45.5 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  39.16 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  36.59 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.83 
 
 		 528 aa  110  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  38.56 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.76 
 
 		 554 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  34.94 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  36.14 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.74 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  38.01 
 
 		 280 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  34.27 
 
 		 303 aa  104  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  34.73 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.13 
 
 		 487 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  44.44 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  34.5 
 
 		 464 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  36.42 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  33.92 
 
 		 303 aa  99  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  31.14 
 
 		 246 aa  97.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  31.82 
 
 		 235 aa  97.8  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  33.53 
 
 		 204 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  33.53 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  34.13 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  34.3 
 
 		 464 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  37.04 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  30.77 
 
 		 303 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.57 
 
 		 458 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.93 
 
 		 626 aa  95.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  32.03 
 
 		 303 aa  94.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  33.52 
 
 		 221 aa  94.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  32.16 
 
 		 303 aa  94.7  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.84 
 
 		 493 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.24 
 
 		 462 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  30.54 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  33.53 
 
 		 312 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.56 
 
 		 464 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  31.74 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  30.36 
 
 		 307 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  32.68 
 
 		 303 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  32.18 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  31.87 
 
 		 303 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  33.92 
 
 		 303 aa  92.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.94 
 
 		 480 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  30.95 
 
 		 468 aa  92  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  31.87 
 
 		 303 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  29.51 
 
 		 303 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  31.21 
 
 		 303 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  31.52 
 
 		 257 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  32.03 
 
 		 303 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  32.03 
 
 		 303 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  32.03 
 
 		 303 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  33.33 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.74 
 
 		 489 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  38.41 
 
 		 249 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  34.13 
 
 		 306 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.16 
 
 		 462 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  30.41 
 
 		 459 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  33.53 
 
 		 306 aa  89  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  32.24 
 
 		 314 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.06 
 
 		 482 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  30.25 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.17 
 
 		 502 aa  87.8  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  31.13 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  29.82 
 
 		 459 aa  87.8  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.36 
 
 		 464 aa  87.8  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  31.38 
 
 		 226 aa  87.8  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.53 
 
 		 480 aa  87.8  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  32.54 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  32.97 
 
 		 472 aa  87  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.97 
 
 		 472 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  32.97 
 
 		 472 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  32.67 
 
 		 149 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 		 476 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06710  siroheme synthase Met8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05680)  29.65 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.99 
 
 		 473 aa  85.5  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  29.19 
 
 		 225 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  31.55 
 
 		 465 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.36 
 
 		 481 aa  84.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  28.57 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  34 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  31.33 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00750  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  27.51 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  31.1 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.07 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  27.51 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  28.34 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  28.65 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.57 
 
 		 464 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  32.24 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  32.24 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  30.36 
 
 		 465 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  28.05 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  34.13 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  34.13 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>